RSUD Kabupaten Temanggung memiliki dukungan dari Instalasi Farmasi yang buka non stop 24 jam, melayani kebutuhan obat dari para pasien yang membutuhkan baik dari pelayanan rawat inap maupun rawat jalan. Dilakukan pengontrolan dan pengawasan yang ketat dalam pemberian obat kepada pasiennya. memberikan pelayanan meliputi :
1. Peracikan dan pendistribusian obat.
2. Informasi dan pelayanan obat.
3. Penyimpanan obat.
4. Formularium obat RS.
5. Pelayanan one day dosis (ODD).
6. Visite pasien.
7. Konseling pasien.